A total of 2149 individuals (Blanca Celtibérica (BC) = 1,204, Blanca Andaluza (BA) = 945) were sampled from 4 and 47 herds, respectively. The purpose of this work is to analyze the genetic structure of these specially endangered Spanish goat breeds. All of these sampled animals were registered in their Herdbook. Nineteen DNA microsatellite markers have been used following FAO and ISAG recommendations for genetic diversity studies. According to the correspondence analysis, both populations showed a high genetic similarity. In fact, values of gene flow (Nm = 20.550) and the Nei standard genetic distance (DS = 0.034) suggested that the two breeds are closely related. Mean expected heterozygosity (BC = 0.731, BA = 0.722), mean polymorphic information content (PIC) (BC = 0.698, BA = 0.689) and FIS value (BC = 0.011, BA = 0.027), within population, showed that BC has the largest genetic variability. Enough genetic variability within breed was observed in both Blanca Andaluza and Blanca Celtibérica breeds. In conclusion it is necessary to work on individual-population assignments.

Un total de 2149 individus (Blanca Celtibérica (BC) = 1204, Blanca Andaluza (BA) = 945) a été échantillonné à partir de 4 et 47 troupeaux respectivement. L’objectif de ce travail est d’analyser la structure génétique de ces deux races caprines espagnoles menacées d’extinction. Tous ces animaux échantillonnés ont été enregistrés dans leur livre généalogique. Dix-neuf marqueurs microsatellites ont été utilisés suivant les recommandations de la FAO et l’ISAG pour les études de diversité génétique. Selon l’analyse de la correspondance, les deux populations ont montré une grande similitude génétique. En effet, les valeurs du flux génétique (Nm = 20,550) et la distance génétique standard de Nei (Ds = 0,034) suggèrent que les deux races sont étroitement liées. L’hétérozygotie moyenne attendue (BC = 0,731, BA = 0,722), la moyenne du contenu de l’information polymorphe (PIC) (BC = 0,698, BA = 0,689) et la valeur de la FIS (BC = 0,011, BA = 0,027), entre les populations, ont montré que BC possède la plus grande variabilité génétique. Une structure génétique racial assez variable a été observé pour les deux races Blanca Andaluza et Blanca Celtibérica. En conclusion, il est nécessaire de travailler en assignation des individus aux populations.