Despite the new almond cultivars released from breeding programs are displacing the autochthonous cultivars in each area, there are a lot of local cultivars that still have a great interest and they are cultivated in the different areas. Some of them are difficult to identify and frequently the same name is given to different cultivars or a genotype is known with different names. These varieties were selected over the years for its adaptation to warm Mediterranean climate and they are a valuable plant genetic resource that must be protected. The objective of this work is the molecular characterization of Spanish autochthonous almond breeding collections using SSRs. Forty two different early flowering and self-incompatible cultivars were assayed using 5 SSRs of reference in almond: BPPCT007, CPPCT005, MA27a, MA40a and UDP96005. Results have showed the great diversity of this autochthonous germplasm and the effectiveness of SSRs by the correct identification, detecting some synonymies and suggesting the origin of some autochthonous cultivars.

Bien que les nouveaux cultivars d´amandier issus des programmes d´amélioration remplacent les cultivars autochtones dans chaque région, il y a beaucoup de cultivars locaux qui ont encore un grand intérêt et ils sont cultivés dans les différents domaines. Certains d’entre eux sont difficiles à identifier et fréquemment, le même nom est donné à différents cultivars ou un génotype est connu avec des noms différents. Ces variétés ont été sélectionnées au fil des ans pour son adaptation au climat méditerranéen chaud et ils sont une ressource phytogénétique précieuse qui doit être protégée. L’objectif de ce travail est la caractérisation moléculaire des collections espagnoles autochtones d’amandier utilisant SSR. Quarante-deux différents cultivars à floraison précoce et auto-incompatibles ont été analysés en utilisant cinq SSR de référence pour l´amandier: BPPCT007, CPPCT005, MA27a, MA40a y UDP96005. Les résultats ont montré la grande diversité de ce matériel génétique autochtone et l’efficacité de la SSR dans l’identification correcte, la détection de certaines synonymies et pour suggérer l’origine de certains cultivars autochtones.