Fait partie de [OMB65]

2009 - 244 p.

Diversity of the coat protein gene of Citrus tristeza virus (CTV) in the Mediterranean region

Djelouah K., Cerni S., Fonseca F., Santos C., Silva G., D'Onghia A.M., Nolasco G.

Sequence data of the coat protein gene of CTV were retrieved from the GenBank or from tested infected tissues and compiled. A comparison with a comparable set of sequences from worldwide isolates showed a very similar value for the nucleotide diversity and a very similar genetic structure in which the same seven groups of variants are conspicuous. A geographic speciation is not apparent and, probably, differences in the distribution of CTV groups are a result of trade. In countries that usually import propagating material from Spain, the group M predominates while group 3b predominates in countries that import material from Israel.

Les données des séquences du gène de la protéine capsidique du CTV ont été récupérées de la GenBank ou des tissus infectés analysés et ces données ont été rassemblées. Une comparaison avec un ensemble de séquences d'isolats de diverses origines a révélé une similitude élevée pour la diversité des nucléotides et une structure génétique très similaire dans laquelle les mêmes sept groupes de variantes sont importants. Une spéciation géographique n'est pas évidente et, probablement, des différences en termes de distribution des groupes de CTV sont imputables aux échanges commerciaux. Dans les pays qui importent normalement du matériel de multiplication de l'Espagne, le groupe M prédomine alors que le groupe 3b est le plus présent dans les pays qui importent le matériel végétal d'Israël.

Mots-clés    

CLOSTEROVIRUS TRISTEZA DU CITRUS, GENE, NUCLEOTIDE, PROTEINE DE CAPSIDE

Citer cet article    

Djelouah K., Cerni S., Fonseca F., Santos C., Silva G., D'Onghia A.M., Nolasco G. Diversity of the coat protein gene of Citrus tristeza virus (CTV) in the Mediterranean region. In : D'Onghia A.M. (ed.), Djelouah K. (ed.), Roistacher C.N. (ed.). Citrus tristeza virus and Toxoptera citricidus: a serious threat to the Mediterranean citrus industry. Bari : CIHEAM, 2009. p. 159-163. (Options Méditerranéennes : Série B. Etudes et Recherches; n. 65). http://om.ciheam.org/om/pdf/b65/00801409.pdf