Fait partie de [OMA101]

2012 - 677 p.

Genetic structure of Krškopolje pig based on pedigree data

Malovrh S., Planinc M., Kovac M.

Krškopolje pig was persecuted for many years and consequently, population extremely decreased. In the year 1992 when the herdbook was established again, there were less than 30 sows and only 3 boars. Nowadays, the population consists of 150 registered sows and 30 boars. Pedigree data included 730 animals: 162 males and 568 females. Animals born in years 2005-2009 were considered as reference population. The PEDIG program was used for pedigree analyses. Generation intervals were 2 years for sire-son and sire-daughter, and 2.5 years for dam-son and dam-daughter pathways. Average family size for pairs sire-dam was 1.67 progeny with standard deviation (SD) 1.18, while sires as families had 4.08 progeny (SD 5.54). Maximum number of generations was nine. Pedigree completeness was expressed by equivalent complete generations: 3.2 in males and 3.3 in females. Total number of founders was 58. Effective number of founders and ancestors were 20 and 14, respectively. Average coefficient of kinship was 4.9% among males, 4.6% among females and males, and 5.0% among females. Due to incomplete pedigree, coefficients of inbreeding and relationship are underestimated, while effective number of founders and ancestors are overestimated. Sires should have more uniform contribution to the gene pool.

Le cochon de race Kraskopolje a été persécuté pendant de nombreuses années ce qui a provoqué une forte diminution de sa population. À partir de 1992, lorsque le livre généalogique a été remis en place, il ne restait plus que 30 truies et seulement 3 verrats. De nos jours, la population est représentée par 150 truies et 30 verrats enregistrés. Les données concernant le pedigree sont basées sur 730 animaux: 162 mâles et 568 femelles. Les animaux nés durant les années 2005 à 2009 sont considérés comme la population de référence. Le programme PEDIG a été utilisé pour les analyses de pedigree. L'intervalle choisi entre 2 générations est de 2 ans pour la descendance père-fils et père-fille et de 2 ans et demi pour la descendance mère-fils et mère-fille. La taille moyenne d'une famille père-mère est de 1,67 descendants avec un écart-type de 1,18 ; alors que le père peut avoir plusieurs familles et au total 4,08 descendants (avec un écart-type de 5,54). Le nombre maximum de générations est quant à lui de 9. La profondeur du pedigree est, en équivalent de générations complètes, de 3,2 pour les mâles et de 3,3 pour les femelles. Le nombre total de fondateurs est de 58. Le nombre de fondateurs efficaces et d'ancêtres est respectivement de 20 et 14. Le coefficient de parenté a été estimé à 4,9% entre les mâles, à 4,6% entre les mâles et les femelles et à 5% entre les femelles. Le coefficient de consanguinité a été sous-estimé à cause d'un pedigree incomplet et d'un nombre d'animaux fondateurs et d'ancêtres qui a été surestimé. La contribution génétique des mâles devrait être plus uniforme.

Mots-clés    

CONSERVATION DU MATERIEL GENETIQUE, PATRIMOINE, PORCIN, RACE PURE, SLOVENIE, VARIABILITE

Citer cet article    

Malovrh S., Planinc M., Kovac M. Genetic structure of Krškopolje pig based on pedigree data. In : De Pedro E.J. (ed.), Cabezas A.B. (ed.). 7th International Symposium on the Mediterranean Pig. Zaragoza : CIHEAM, 2012. p. 75-79. (Options Méditerranéennes : Série A. Séminaires Méditerranéens; n. 101). 7. International Symposium on the Mediterranean Pig, 2010/10/14-16, Córdoba (Spain). http://om.ciheam.org/om/pdf/a101/00006658.pdf