TY - CHAP AU - Abecia L. AU - Molina Alcaide E. AU - Cantalapiedra-Híjar G. AU - Soto E.C. AU - Carro M.D. PY - 2013/// TI - Effects of forage type on diversity in bacterial pellets isolated from liquid and solid phases of the rumen content in sheep and goats T2 - Feeding and management strategies to improve livestock productivity, welfare and product quality under climate change PB - Zaragoza : CIHEAM / INRAT / OEP / IRESA / FAO VL - 107 T3 - Options Méditerranéennes : Série A. Séminaires Méditerranéens SP - 9-16 A2 - Ben Salem H. A2 - López-Francos A. AB - Two sheep and two goats, fitted with a ruminal cannula, received two diets composed of 30% concentrate and 70% of either alfalfa hay (AL) or grass hay (GR) as forage in a two-period crossover design. Solid and liquid phases of the rumen were sampled from each animal immediately before feeding and 4 h post-feeding. Pellets containing solid associated bacteria (SAB) and liquid associated bacteria (LAB) were isolated from the corresponding ruminal phase and composited by time to obtain 2 pellets per animal (one SAB and one LAB) before DNA extraction. Denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) analysis of 16S ribosomal DNA was used to analyze bacterial diversity. A total of 78 and 77 bands were detected in the DGGE gel from sheep and goats samples, respectively. There were 18 bands only found in the pellets from sheep fed AL-fed sheep and 7 found exclusively in samples from sheep fed the GR diet. In goats, 21 bands were found only in animals fed the AL diet and 17 were found exclusively in GR-fed ones. In all animals, feeding AL diet tended (P < 0.10) to promote greater NB and SI in LAB and SAB pellets compared with the GR diet. The dendrogram generated by the cluster analysis showed that in both animal species all samples can be included in two major clusters. The four SAB pellets within each animal species clustered together and the four LAB pellets grouped in a different cluster. Moreover, SAB and LAB clusters contained two clear subclusters according to forage type. Results show that in all animals bacterial diversity was more markedly affected by the ruminal phase (solid vs. liquid) than by the type of forage in the diet. AB - L\'objectif de cette étude était d\'analyser la diversité des communautés bactériennes à partir d\'extraits isolés dans les phases liquide (LAB) et solide (SAB) du contenu de rumen d\'ovins et de caprins nourris avec des régimes différant par le type de fourrage. Les deux régimes expérimentaux consistaient (base matière sèche) en 30% de concentré et 70% de foin de luzerne (AL) ou de foin de graminées (GR). Deux brebis et deux chèvres, porteuses de canule ruminale, ont reçu le régime alimentaire selon un schéma en cross-over avec deux périodes. Les bactéries SAB et LAB ont été isolées à partir de chaque animal immédiatement avant la distribution de l\'alimentation (0 h) ou 4 h après cette distribution. A chaque période, les extraits bactériens ont été échantillonnés afin d\'avoir 2 extraits bactériens par animal (un SAB et LAB) avant extraction de l\'ADN. L\'analyse de l\'ADN ribosomal 16S par la technique d\'electrophorèse sur gel en gradient dénaturant (DGGE) a été utilisée pour établir la diversité bactérienne. Deux gels DGGE différents ont été réalisés, l\'un pour les échantillons des brebis et l’autre pour ceux des chèvres. Au total, 78 et 77 bandes ont été détectées dans le gel des échantillons, respectivement, de brebis et de chèvres. Parmi elles, 18 bandes ne se sont retrouvées que chez les brebis recevant le régime AL, et 7, que dans des échantillons provenant de brebis nourries avec le régime GR. Pour les caprins, 21 bandes ne se trouvaient que chez les animaux nourris avec le régime AL et 17 ont été trouvées exclusivement chez les animaux recevant le régime GR. Il n\'y a eu aucune interaction espèce animale x régime alimentaire (p> 0,05), que ce soit dans le nombre de bandes (NB) ou pour l\'indice de Shannon (IS), ce qui indique que les populations bactériennes des deux espèces animales ont répondu de la même façon aux changements liés au type de fourrage. Il n\'y a eu aucune différence (P> 0,05) entre les deux espèces animales pour le nombre ou l\'indice de Shannon pour les extraits SAB, mais les extraits LAB des brebis avaient un nombre plus élevé (P <0,05) de bandes et un index SI supérieur aux chèvres. Chez tous les animaux, la distribution du régime AL tend (P <0,10) à augmenter NB et SI pour les extraits LAB et SAB par rapport à celle du régime GR. Le dendrogramme généré par l\'analyse typologique a montré que, chez les deux espèces animales, tous les échantillons peuvent être inclus dans deux grands clusters. Les quatre extraits SAB se sont regroupés dans un cluster différant de celui regroupant les quatre extraits LAB. Par ailleurs, les clusters SAB et LAB contenaient deux sous-groupes bien différenciés correspondant au type de fourrage. Les résultats montrent que, chez tous les animaux, la diversité bactérienne a été plus influencée par l’extrait bactérien analysé (LAB ou SAB) que par le type de fourrage dans le régime. N1 - 14. International Seminar of the Sub-Network on Nutrition of the FAO-CIHEAM Inter-Regional Cooperative Research and Development Network on Sheep and Goats, 2012/06/15-17, Hammamet (Tunisia) UR - http://om.ciheam.org/om/pdf/a107/00006979.pdf ER -