Self-compatibility in almond (Prunus amygdalus Batsch) is attributed to the presence of the Sf haplotype, allelic to and dominant over the series of S-alleles controlling self-incompatibility. Some forms of the Sf haplotype, however, are phenotypically self-incompatible even though their nucleotide sequences are identical. DNA from leaves and styles from genetically diverse almond samples was cloned and sequenced and then analyzed for changes affecting Sf variants. Epigenetic changes in several cytosine residues were detected in a fragment of 4700 bp of the 5’ upstream region of all self-compatible samples of the Sf allele, differentiating them from all self-incompatible samples of Sf analyzed. This is the first report of DNA methylation in a Rosaceae species and appears to be strongly associated with inactivation of the Sf allele.

L’auto-compatibilité chez l’amandier (Prunus amygdalus Batsch) est attribuée à la présence de l'haplotype Sf, allélique avec et dominant sur la série d’allèles S qui contrôlent l’auto-incompatibilité. Néanmoins, quelques formes de l'haplotype Sf sont phénotypiquement auto-incompatibles malgré l’identité des séquences de nucléotides. Le DNA de feuilles et de styles de différents génotypes d’amandier a été cloné, séquencé et après analysé pour les changements pouvant affecter les variantes de l’allèle Sf. Des changements épigénétiques pour quelques résidus de cytosine ont été détectés dans un fragment de 4700 bp de la région 5’ upstream de tous les génotypes auto-compatibles de l’allèle Sf, ce qui les différencie de tous les génotypes auto-incompatibles de l’allèle Sf analysés. Ce résultat est le premier rapport sur la méthylation du DNA dans une espèce de Rosacées et semble être fermement associé avec l’inactivation de l’allèle Sf.